Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNAPC1Q16533 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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