Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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