Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VAMP3Q15836 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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VAMP3Q15836 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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