Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC85BQ15834 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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