Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TAF1AQ15573 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF1AQ15573 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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