Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF11Q15544 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms