Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms