Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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