Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCLAFQ15004 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCLAFQ15004 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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