Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMB3Q13751 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAMB3Q13751 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms