Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TUBB3Q13509 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBB3Q13509 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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