Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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TOP3AQ13472 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3AQ13472 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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