Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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