Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SNTB2Q13425 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms