Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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