Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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GPS1Q13098 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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