Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCAPQ12770 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms