Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFFO1Q0D2I5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms