Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDE4DQ08499 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms