Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM3Q08188 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms