Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms