Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms