Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DSC2Q02487 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms