Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDC42EP1Q00587 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms