Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK17Q00537 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK17Q00537 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms