Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms