Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms