Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB1P82279 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB1P82279 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB1P82279 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms