Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK2A1P68400 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms