Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP1CAP62136 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP1CAP62136 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms