Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VBP1P61758 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VBP1P61758 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms