Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P61574 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms