Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPS3AP61247 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPS3AP61247 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms