Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF3P61204 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms