Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CABP4P57796 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP4P57796 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP4P57796 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP4P57796 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP4P57796 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms