Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NRG3P56975 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NRG3P56975 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NRG3P56975 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms