Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTBP2P56545 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms