Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms