Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms