Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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