Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSEN1P49768 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSEN1P49768 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms