Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX1P48742 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms