Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTRNP46939 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTRNP46939 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTRNP46939 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms