Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCAMP43121 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCAMP43121 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCAMP43121 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms