Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V1E1P36543 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms