Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFTPDP35247 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms