Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPC1P35052 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms