Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms