Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms