Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DNMT1P26358 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms